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バイオグリッド スパコン創薬プロジェクト

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KBDD (K supercomputer-Based Drug Discovery project by Biogrid pharma consortium)プロジェクトとは、NPO法人バイオグリッドセンター関西が運営しているスパコンにおける創薬基盤を構築するコンソーシアムで、製薬企業20社超、IT企業2社、京大、産総研、都市活力研究所、先端医療振興財団が参画しています。
2012年度には、蛋白質約600と低分子化合物3000万の相互作用を機械学習法(SVM)で計算し参画の製薬企業にデータを提供しました。
また、2012年度から蛋白質と化合物の結合自由エネルギーを見積もるアプリケーションMP-CAFEEの産業利用の可能性について検証を行なっており、計算精度の検証、一連のワークフローの構築、GUIの開発などを行なってきました。今後はこれらのノウハウを提供し、創薬の現場で利用できるようにし、さらに新たなアプリケーションについても順次検証を行い、創薬現場で利用できるようにする予定です。

サイエンスZERONHK サイエンスZERO 「これが世界一のシミュレーション!“スーパーコンピュータ京”」
がNHK オンデマンドで1年間ネット配信。

KBDDメンバー

機   関

申請主体

NPO法人バイオグリッドセンター関西

製薬企業(50音順)

旭化成ファーマ(株)

アステラス製薬(株)

アスビオファーマ(株)

エーザイ(株)

小野薬品工業(株)

科研製薬(株)

(株)カネカ

キッセイ薬品工業(株)

杏林製薬(株)

参天製薬(株)

塩野義製薬(株)

千寿製薬(株)

大正製薬(株)

田辺三菱製薬(株)

帝人ファーマ(株)

東レ(株)

日産化学工業(株)

機   関

日本新薬(株)

富士フイルム(株)

マルホ(株)

meiji seikaファルマ(株)

持田製薬(株)

 

IT企業

(株)京都コンステラ・テクノロジーズ

三井情報(株)

大学(以下順不同)

京都大学大学院 医学研究科

大阪大学

神戸大学

横浜市立大学

公的機関

(公財)都市活力研究所

産業技術総合研究

(公財)先端医療振興財団

理化学研究所

 



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